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新品发布|乳酸化的逆袭兄弟,衣康酸化修饰蛋白组强势来袭!

发布时间:2025-01-20

老是为所有原科而被耳熟能详的衣康酸(Itaconate,ITA),与乳酸从“产生危化物”变成“藏宝图小团伙”的艰辛成果似的,到近三十年才被发展其核心的生物工程学用途,从次“起身农奴把唱歌”,非常是在免疫力宫颈真菌感染性症状分析的领域内异彩纷呈。已建多页医学论文报到了在几种宫颈真菌感染性症状的家禽沙盘模型中索取衣康酸或其检查是否淡化双重性物工程的治愈益处,消息队列展其隐藏靶点。至于衣康酸的“前世姻缘”与“这辈子”,具体情况见微信文章《乳酸的逆转好兄弟——衣康酸!文中让你要了解衣康酸》。

拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康酸性反应表达蛋白质组学产品,实现1000+什么难以理解的度装饰位点验出,固定再现经典传奇靶点,全位子生信分析一下解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“遇到”到“效验”全过程业务,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。

PART 1

01、检测环节

02、监测数值

03、经“点”复现

在场地实测统计数据中,检测很多参考文献中新闻报道的经典爱情靶点举例衣康酸掩盖位点,如第一次个被表明的衣康酸共价掩盖淀粉酶KEAP1,也有糖酵解径路中的3个最为核心的酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,并且炎性小体组合成淀粉酶NLRP3和受损细胞病变步骤中的最为核心的淀粉酶RIPK3等,其质谱图给出图下图。

04、产品的特殊性

1.很多质控

商业楼化特男人查重器孵育、SDS-PAGE查重、WB印证、样板相关内容性进行分析等各个位查重,事关该项目最终结果靠得住性。

2.高耐热性质谱检测仪器品台

在Orbitrap Astral全新一批高分别质谱仪作明佛母心咒下,保持衣康碱化装饰位点及蛋清签别新长度,转向完美研究方案新挖掘。

3.全流程步骤一走式工作

为拜谱怪物建全的科学试验品台,可带来了“細胞培训→查重器孵育→WB查重→玄之又玄度衣康过酸淡化查重→专属密码生信分析一下→某位点PRM认证”全的流程功能,省时省功更可靠。

05、研究玩法(地方)

06、操作方问

PART 2、文献资料微信分享

论文一

用英语题头:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)

繁体中文一级标题:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析

分析主要内容:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。

(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)

专著二

因为宝贝标题:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)

汉语关键词:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性

钻研信息:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。

(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)

PART 3、情况繁衍设想

蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13都具有弱于的底物整合性能,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。

S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。

(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)

值得一提的是,在拜谱动物衣康碱化表达组测试统计数据中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康碱化掩盖(如下图所示图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。

PART 4、拜谱个人心得体会

算作TCA不断循环中的中部分解代谢转化率物,衣康酸缓解分解代谢转化率、免役和发炎区间内的相互间效用,为控制方法免役发炎性患病供应了代换控制方法攻略 。衣康酸框架中的亲电性α,β-不呈现饱和状态羧酸框架能对高蛋清质上的灵活性半胱氨酸残基使用烷基化表达语(迈克尔减伤反响),某些泰语翻译后表达语被通称“衣康酸表达语(itaconation)”,而使影响力高蛋清质功用,宏观调控免役回话和分解代谢转化率路径,为各种各样患病肿瘤药物研发团队供应新一个构想。

拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康酸性反应掩盖蛋白酶组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物医学检验绝对性定量分析靶向疗法产生组(QMT1000)或能源排泄靶向治疗排泄组品牌对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!

参考选取论文论文参考文献

1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.
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